Datos de biodiversidad Publica en GBIF.ES Herramientas de validación y publicación

Herramientas de validación y publicación

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herramientas de detección

Open Refine

Open Refine es una aplicación de escritorio de código abierto independiente que sirve para la limpieza y transformación de datos a otros formatos. Es muy parecida a aplicaciones de hojas de cálculo (y puede trabajar con formatos de hojas de cálculo); sin embargo, se comporta más bien como una base de datos.

http://code.google.com/p/google-refine/

herramientas de detección

QuantumGIS

Una interesante alternativa a Diva GIS, que resulta más generalista, no tan enfocada a biología, pero que posee código abierto, disponibilidad para trabajar en múltiples plataformas (Windows, Mac, Linux), es desarrollada continuamente de manera muy rápida y muy eficaz y presenta un sistema de complementos muy interesante.

http://www.qgis.org/

herramientas de detección

Diva GIS

Herramienta sencilla pero muy buena desde el punto de vista de los Sistemas de Información Geográfica. Resulta muy útil para científicos que trabajan en biodiversidad para obtener un vistazo general de los aspectos espaciales de sus datos. También está muy orientada a temas ambientales y de modelización, por lo que puede resultar muy sencilla en su manejo pero ofrecer funcionalidades avanzadas en estas temáticas. Además es una aplicación gratuita pero que solo funciona en entorno Windows. Sin embargo, puede utilizarse en MAC mediante wine/winebotller. La aplicación ofrece datos espaciales gratuitos y un foro de ayuda disponibles en su página web.

http://www.diva-gis.org/

georreferenciación

Calculadora de georreferenciación

Una herramienta muy útil para estimar la precisión / exactitud de los datos geográficos basada en fórmulas/buenas prácticas  de Arthur Chapman, y escritas (y  actualizadas) por John Wieczorek. No siempre es fácil de usar debido a la cantidad de datos de entrada requeridos, pero es muy detallado y no hay muchas herramientas de este tipo.

http://georeferencing.org/manis/gci2.html

geográficas

InfoXY de Species Link

Esta herramienta fue desarrollada por CRIA con el objetivo de ayudar a las colecciones biológicas en la validación de datos geográficos. Al ingresar datos sobre coordenadas geográficas, la herramienta devuelve información sobre el punto, como el nombre del país, estado o región administrativa, y el nombre del municipio o distrito. Si el punto está en el mar, la herramienta calculará la distancia hasta la costa más cercana, indicando el nombre del país. .

http://splink.cria.org.br/infoxy?criaLANG=en

validación

Validador de datos de GBIF

El validador de datos de GBIF es un servicio que permite a cualquier persona cargar un conjunto de datos en formato de publicación de GBIF  (Archivos en formato Darwin Core Archive o CSV con los términos del estándar) para obtener un informe sobre la validez de su estructura  y contenido.  Una vez hecho el procesamiento, se obtiene un resumen de los problemas encontrados durante la interpretación de GBIF y un desglose detallado de los problemas encontrados en  datos y metadatos.

http://tools.gbif.org/dwca-validator/

validación

Darwin Test

Darwin Test es una aplicación basada en MS Access, diseñada para la validación y chequeo de los datos presentados en el estándar Darwin Core (Darwin Core versión 1.2, Darwin Core 1.4 y Darwin Core Archive), formato utilizado por GBIF para el intercambio de información sobre biodiversidad (observaciones, especímenes conservados en colecciones de historia natural, muestras e información relacionada).

Se recomienda utilizar esta herramienta para detectar posibles errores en los datos y como paso previo a su publicación en la red de GBIF.

https://gbif.es/software/darwin-test/

tesauros de códigos iso

Country subdivisions ISO 3166-2 codes as MS Access

Es un estándar internacional que define los códigos de identificación de las principales subdivisiones (por ejemplo, provincias o estados) de todos los países codificados en ISO 3166-1.  Ha sido publicada por la Organización Internacional de Normalización y tiene como propósito el establecimiento de códigos reconocidos de manera internacional. Es el código empleado en las aplicaciones Elysia y Darwin Test desarrolladas por GBIF España.

https://gbif.es/wp-content/uploads/2018/02/Provincias.zip

tesauros de códigos iso

Countries ISO 3166-1 codes as MS Access

Es un estándar internacional que expresa los códigos de país con dos letras. Ha sido publicada por la Organización Internacional de Normalización y tiene como propósito el establecimiento de códigos  reconocidos de manera internacional para la representación de nombres de países. Su uso es recomendado por el estándar Darwin Core  para expresar los valores del campo CountryCode  y se utiliza en las aplicaciones Elysia y Darwin Test desarrolladas por GBIF España.

https://gbif.es/wp-content/uploads/2018/02/Paises.zip

tesauros de checklists

Fish: FishBase

FishBase es un sistema de información mundial de biodiversidad sobre peces de aleta. Su objetivo inicial de proporcionar hechos clave sobre dinámicas poblacionales para las 200 especies comerciales principales, ahora ha crecido lo suficiente como para contener un amplio rango de información sobre todas las especies conocidas actualmente en el mundo: taxonomía, biología, ecología trófica, historia viva y usos, así como datos históricos de más de 250 años de antigüedad.

http://www.fishbase.org/

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